《拳皇2001》报告正在THE KING OF FIGHTERS 2000大会举行历程中，一个乡村被卫星刀兵ZERO CANON捣毁了。可是各个国度的报纸却拆穿说这是野生卫星事变。
固然“停止一定会失事的KOF大会"之声很多，但取笑的是，这个出名的搏斗大会却再次复原人气。并且人门的热中水平乃至比KOF97加倍凶猛。
可是，正在这个全球性的大会中，一个惊人的现实渐渐被揭发开来，大会参赛者的名单中居然有N.E.S.T.S. TEAM的呈现!! 大会主理者的真正目标事实是甚么呢?并且今次的大会并无保障悲剧不会再次产生……
THE KING OF FIGHTERS N.E.S.T.S.的第3篇。所有城市正在今次的大会后结束!!
KOF2001包含10支步队，和99/2000同样，每一个步队由4团体构成。不edit公用脚色了，Kyo和Iori都正在步队当中。有一个新步队和4个新人物;新步队是NESTS队：由Kula和3个新人物(Foxy，Angel，和K9999)构成。剩下的一个新人物是Mei-Li，她将正在韩国队，取代了全勋的地位。